ibidi ibidi Pump System, Instruction Manual

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ibidi Pump System
4 Quick Start Guide 32
5 Basic Setup 33
5.1 General Setup of the Components . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
5.2 Connecting the Fluidic Unit to the Pump . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
5.3 Connecting the Drying Bottle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
5.4 Installing the PumpControl Software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
5.5 Connecting the ibidi Pump to the Computer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
6 Setting Up an Experiment With Cells 37
6.1 Degassing of Slides, Tubing, and Medium . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
6.2 Mounting a Perfusion Set on the Fluidic Unit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
6.3 Filling the Perfusion Set with Medium . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
6.4 Remove Air Bubbles from the Perfusion Set . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
6.5 Pinch Test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
6.6 Calibration of the Flow Rate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
6.6.1 Connect the Calibration Slide to the Perfusion Set . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
6.6.2 Flow Rate Measurement . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45
6.6.3 Flow Calibration in the Software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
6.7 Connect the Cell-Seeded Slide to the Perfusion Set . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
6.8 Start the Flow . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
6.9 Observing Cells on the Microscope . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
6.10 Medium Exchange . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
6.10.1 Medium exchange with left-over conditioned medium (option 1): . . . . . . . . 49
6.10.2 Complete medium exchange (option 2): . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
Version 2.6 (May 12, 2022) 4 Instruction Manual