background image

 

Benchmark Thermal Cycler User Manual 

 

 

 

1.5 Edit Step . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  18 

 

 

 

1.6 Delete Step . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  18 

 

 

 

1.7 Save Program . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    18 

 

 

2. Edit Program . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  19 

 

 

3. Program Wizard Function . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    20 

 

 

 

 

 

1. Load Samples into the Instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    21 

 

 

2. Select Program to Run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    21 

 

 

3. View Run State and Control Run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    22 

 

 

 

3.1 View Run State . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    22 

 

 

 

 

Run Screen . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    23 

 

 

 

 

View Run Timer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    24 

 

 

 

 

View Bar Chart of Sample Block Temperature . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  24 

 

 

 

 

View Temperature Record Curve . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    24 

 

 

 

 

View Run Report . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    24 

 

 

 

3.2 Control Run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  25 

 

 

 

 

Pause Run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  25 

 

 

 

 

Skip Run Step . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    25 

 

 

 

 

Stop Run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  25 

 

 

 

 

Run Program Again . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    25 

 

 

 

 

 

1. System Setting Screen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    25 

 

 

2. About . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  26 

 

 

3. Incubation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  26 

 

 

4. Gradient Calculator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    26 

 

 

5. View Report . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  26 

 

 

6. Tm Calculator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 

27 

 

 

7. Check . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 

27 

 

 

8. Configure Shortcut . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    28 

 

 

9. Admin Options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 

29 

 

 

 

9.1 Access Control . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    29 

 

 

 

9.2 Thermal Cycler Name/IP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    30 

 

 

 

9.3 Set Date/Time . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    31 

 

 

 

9.4 Run-time Accuracy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    31 

 

 

 

9.5 User Message . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    31 

Run Program 

 

System Setting 

 

Summary of Contents for TC 9639

Page 1: ...TC 9639 Thermal Cycler User Manual Document Version 1 4 99 Washington Street Melrose MA 02176 Phone 781 665 1400 Toll Free 1 800 517 8431 Visit us at www TestEquipmentDepot com...

Page 2: ...10 1 2 Add Folder 11 1 3 Rename Folder 11 1 4 Delete Folder 11 2 Manage Program 12 2 1 View Program Screen 12 2 2 Rename Program 12 2 3 Copy Program 13 2 4 Delete Program 13 2 5 View Last Run Program...

Page 3: ...View Bar Chart of Sample Block Temperature 24 View Temperature Record Curve 24 View Run Report 24 3 2 Control Run 25 Pause Run 25 Skip Run Step 25 Stop Run 25 Run Program Again 25 1 System Setting Scr...

Page 4: ...ovides information that must be read carefully Failure to follow the information will possibly result in damage to the instrument or the user For example Suggested Operation Support Information For th...

Page 5: ...ight and force of lid Lid Handle Opens and closes the lid USB Port Connects to a USB flash drive Touchscreen Views and controls the instrument Air Vents Allows air to circulate into and out of the ins...

Page 6: ...iew graph or curve Accepts present parameters setting and closes the screen Close the screen without changing any parameters Runs a selected program or incubation mode Figure 3 Virtual keyboard Text i...

Page 7: ...centrifuge The recommended distance between the instrument and the back wall is 20 cm 7 9 in Two thermal cyclers can be placed side by side 1 2 Unpacking 1 Remove the packaging materials and keep in c...

Page 8: ...then place reaction vessels in the sample block or remove samples from the block To close the lid 1 Place reaction vessels into the wells of the sample block 2 Hold the lid handle and handle clamp an...

Page 9: ...running program which set temperature control mode as Sim tube and estimated remaining run time b Shows date day and time Home Screen Buttons Button Function When login is enabled touch this button t...

Page 10: ...Long_PCR for amplifying of extra long nucleic acid chain RT_PCR for synthesizing DNA from RNA by reverse transcriptase Ligation_16C for connecting segmental DNA with vector DNA at 16 C Enzyme_37C for...

Page 11: ...the Program Library screen select a folder and then touch Rename 2 In the Rename Folder screen Clear the old folder name enter a new name and then touch Ok to accept changes 1 4 Delete Folder To dele...

Page 12: ...ction View Edit Views and or edits program steps see chapter D for details New Creates a new program see chapter D for details Rename Renames a selected program Copy Copies program between folders Del...

Page 13: ...er name and then touch Ok to return the Copy Program screen c Touch Export to copy the program to a USB flash drive 2 4 Delete Program To delete a program 1 In the View Program screen select a program...

Page 14: ...Program screen The Edit Program screen is used to create view and edit programs After adding several steps the screen looks like below Items in the Edit Program screen a Step number b Temperature for...

Page 15: ...e as Saves another copy of the opened program Run Runs the program 1 2 Set Temperature Control Mode and Lid Temperature 1 In the Edit Program screen touch Head The Head screen opens 2 Select temperatu...

Page 16: ...ect it When the step is selected the background becomes blue 2 Touch Temp and the Temp Step screen opens 3 Edit Temperature and Time If you touch Pause the program will automatically pause as soon as...

Page 17: ...Adjust the heating or cooling ramp rate To set the Slow Ramp function Enter the value of ramp rate in the textbox Input range is 0 1 6 0 C sec 5 Touch Ok to accept changes and close the screen 1 4 Se...

Page 18: ...op up window appears 3 Touch Yes in the displayed pop up window to delete the step 1 7 Save Program 1 In the Edit Program screen touch Save or Save As to display the Save As Program Screen 2 The curre...

Page 19: ...then double click it or touch View 3 In the View Program screen select a program to be edited and then and then double click it or touch View Edit 4 In the Edit Program screen you can edit the progra...

Page 20: ...exclude the specified step You can touch Graph to view the graphical representation of the program 4 Touch Save to save program or touch Run and then select whether save the program before running ac...

Page 21: ...am screen Select a program from the list and touch Run After you touch Run the Set Run Options screen opens 2 In the Set Run Options screen edit Temperature Control and Lid Temperature Control 3 Touch...

Page 22: ...block temperature when the instrument is idle or when temperature control mode is Block or sample temperature when temperature control mode is Sim tube Cycle current cycle numbers total cycle numbers...

Page 23: ...gain Edit Opens Edit Program screen to edit the program Report Views run report View Run Timer 1 In the Run screen touch View Timer to view run time Time Elapsed shows the time hour min since the run...

Page 24: ...ng running Touch Export to export the report in BMP format to a USB flash drive 2 Touch to return to the Run screen 3 2 Control Run Pause Run In the Run screen touch Pause and the system will beep twi...

Page 25: ...lue of a primer pair Check This function is reserved for service Configure Shortcut Configures functions or programs shortcuts Admin Options Sets instrument parameters Login Password When a user other...

Page 26: ...touching View Timer You can stop running by touching Stop 4 Gradient Calculator This button does not function 5 View Report 1 In the Home screen touch System Setting 2 In the System Setting screen to...

Page 27: ...n 7 Check This function is reserved for service 8 Configure Shortcut Shortcuts appear on the Home screen and can access various functions or programs When login is enabled each user can configure diff...

Page 28: ...ish touch Ok to return to the Home screen The selected function or program will appear in the Home screen 9 Admin Options The Admin Options is used to control access mode set thermal cycler name IP ad...

Page 29: ...he Admin Options screen touch Access Control The Access Control screen opens 4 To enable the Access Control function touch Require Login a To allow anyone to create a new account in the Login screen t...

Page 30: ...Date Time When login is enabled log in as admin 1 In the Home screen touch System Setting 2 In the System Setting screen touch Admin Options 3 In the Admin Options screen touch Date Time 4 In the Date...

Page 31: ...delete and run programs set his or her shortcuts modify his or her login password in the System Setting screen after login In the User Message screen a To create a new user account touch Create to ope...

Page 32: ...99 Washington Street Melrose MA 02176 Phone 781 665 1400 Toll Free 1 800 517 8431 Visit us at www TestEquipmentDepot com...

Reviews: